去除核酸提取步驟
我們已經(jīng)知道,大規(guī)模的核酸檢測和對受到感染的患者接觸過的人進(jìn)行追蹤,是控制新冠疫情擴展的有效手段之一。目前最常見的檢測方法是使用鼻咽拭子獲取樣本進(jìn)行基于RT-PCR的核酸檢測。然而,獲取鼻咽拭子樣本的過程對人們來說并不是一個很舒服的過程,而且目前的核酸檢測大多需要經(jīng)過從樣本中純化提取核酸的步驟。這一步驟不但增加了處理樣本的時間和成本,也可能因為核酸純化試劑盒的短缺而影響新冠檢測的速度。
耶魯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院的研究人員力圖開發(fā)一種基于唾液樣本的“簡易版”新冠病毒檢測。他們首先通過實驗發(fā)現(xiàn),在沒有添加防腐劑的情況下,唾液中的新冠病毒RNA在室溫和30°C情況下保存的穩(wěn)定性與在4°C情況下穩(wěn)定性相當(dāng)。這意味著唾液樣本不需要特制的樣本瓶來收集,任何無菌樣本瓶都可以用于收集唾液樣本,為收集唾液樣本提供了便利。
然后,研究人員進(jìn)一步探索簡化核酸檢測流程的方法。他們將樣本處理過程簡化為將蛋白酶K(在DNA提取過程中常用的一種蛋白酶)加入樣本中降解蛋白之后,直接將處理過的樣本用于RT-PCR的檢測流程,去除了從樣本中純化提取核酸的步驟。
研究人員的實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn),基于唾液樣本,去除純化提取核酸步驟的“簡易版”檢測流程得出的檢測結(jié)果,與基于鼻咽拭子,使用純化提取核酸步驟的常規(guī)RT-PCR檢測相比,結(jié)果相關(guān)性達(dá)到94%。
▲SalivaDirect核酸檢測流程和測試表現(xiàn)(圖片來源:參考資料[3])
擴展檢測適用范圍
為了讓這一檢測能夠被更多的檢測實驗室使用,研究人員還使用不同廠家生產(chǎn)的蛋白酶K和RT-PCR試劑盒進(jìn)行了測試。他們發(fā)現(xiàn)多種常見的蛋白酶K和RT-PCR試劑盒可以用于這一“簡易版”新冠檢測流程,檢測靈敏度達(dá)到6-12個新冠病毒拷貝/微升。這意味著,很多檢測實驗室不需要購買特別的試劑,只要遵循耶魯大學(xué)發(fā)布的檢測流程,利用手邊已有的試劑就可以構(gòu)建這一檢測。
▲經(jīng)過驗證適用于SalivaDirect流程的試劑和儀器(圖片來源:參考資料[3])
耶魯大學(xué)的研究人員同時表示,他們將為所有感興趣的檢測實驗室提供“開源“檢測流程,幫助它們提高新冠病毒檢測的效率。同時他們正在進(jìn)一步驗證這一檢測流程在發(fā)現(xiàn)無癥狀患者方面的能力。研發(fā)人員表示,針對新冠病毒的檢測需要不斷的創(chuàng)新,從而在保持檢測準(zhǔn)確性的情況下,讓它們更為迅速,便捷,可及性更高,這項研究是向這一方向邁出的重要一步。