在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的研究人員首次對(duì)SARS-CoV-2進(jìn)行分子流行病學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)美國(guó)紐約市首批確診的COVID-19病例主要來(lái)源于歐洲和美國(guó)其他地方。相關(guān)研究結(jié)果于2020年5月29日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in the New York City area”。
這項(xiàng)研究首次追蹤了這些病例的來(lái)源,并表明紐約市的SARS-CoV-2疫情主要是通過(guò)美國(guó)和歐洲之間未經(jīng)追蹤的傳播引起的,而支持從中國(guó)或亞洲其他地方直接引入的證據(jù)并不充分。這些研究人員還記錄了在此期間SARS-CoV-2在紐約市的早期社區(qū)傳播。
紐約市已經(jīng)成為美國(guó)SARS-CoV-2感染的主要疫情中心之一,在這個(gè)大都市地區(qū)有近17000人死亡。了解這種病毒何時(shí)來(lái)到紐約,以及它的傳播路線,對(duì)于評(píng)估和設(shè)計(jì)遏制策略至關(guān)重要。
這些研究人員對(duì)在西奈山衛(wèi)生系統(tǒng)的一家醫(yī)院尋求護(hù)理的患者體內(nèi)的SARS-CoV-2病毒進(jìn)行了測(cè)序。對(duì)84個(gè)不同的SARS-CoV2基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析表明紐約市的這種病毒主要由歐洲和美國(guó)其他地區(qū)的多個(gè)獨(dú)立但孤立的來(lái)源引入。在居住在不同街區(qū)的患者身上發(fā)現(xiàn)的相關(guān)病毒集群表明,社區(qū)傳播在3月18日之前就已經(jīng)開(kāi)始。
論文共同作者、西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院研究生Brianne Ciferri說(shuō),“我們的研究為這種新型病毒病原體的起源和多樣性提供了意想不到的見(jiàn)解。我們發(fā)現(xiàn)了明確的證據(jù),表明有來(lái)自世界和美國(guó)其他地方的多個(gè)不同病毒來(lái)源獨(dú)立地引入紐約大都市地區(qū)。此外,我們?cè)谡麄€(gè)城市的不同街區(qū)發(fā)現(xiàn)了病毒毒株集群,這表明在3月18日之前,未被追蹤的社區(qū)傳播已經(jīng)在進(jìn)行。我們的研究結(jié)果凸顯了在出現(xiàn)這種新型病原體的情況下,采取早期公共衛(wèi)生應(yīng)對(duì)措施的必要性。希望我們所發(fā)現(xiàn)的有關(guān)早期病毒傳播和引入而成為全國(guó)疫情中心的證據(jù),能夠?yàn)榻窈笤谝咔樵缙趹?yīng)對(duì)階段開(kāi)展的公共衛(wèi)生工作提供指導(dǎo)。”
這項(xiàng)研究首次追蹤了這些病例的來(lái)源,并表明紐約市的SARS-CoV-2疫情主要是通過(guò)美國(guó)和歐洲之間未經(jīng)追蹤的傳播引起的,而支持從中國(guó)或亞洲其他地方直接引入的證據(jù)并不充分。這些研究人員還記錄了在此期間SARS-CoV-2在紐約市的早期社區(qū)傳播。

美國(guó)紐約市SARS-CoV-2確診病例,圖片來(lái)自Science, 2020, doi:10.1126/science.abc1917。
紐約市已經(jīng)成為美國(guó)SARS-CoV-2感染的主要疫情中心之一,在這個(gè)大都市地區(qū)有近17000人死亡。了解這種病毒何時(shí)來(lái)到紐約,以及它的傳播路線,對(duì)于評(píng)估和設(shè)計(jì)遏制策略至關(guān)重要。
這些研究人員對(duì)在西奈山衛(wèi)生系統(tǒng)的一家醫(yī)院尋求護(hù)理的患者體內(nèi)的SARS-CoV-2病毒進(jìn)行了測(cè)序。對(duì)84個(gè)不同的SARS-CoV2基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析表明紐約市的這種病毒主要由歐洲和美國(guó)其他地區(qū)的多個(gè)獨(dú)立但孤立的來(lái)源引入。在居住在不同街區(qū)的患者身上發(fā)現(xiàn)的相關(guān)病毒集群表明,社區(qū)傳播在3月18日之前就已經(jīng)開(kāi)始。
論文共同作者、西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院研究生Brianne Ciferri說(shuō),“我們的研究為這種新型病毒病原體的起源和多樣性提供了意想不到的見(jiàn)解。我們發(fā)現(xiàn)了明確的證據(jù),表明有來(lái)自世界和美國(guó)其他地方的多個(gè)不同病毒來(lái)源獨(dú)立地引入紐約大都市地區(qū)。此外,我們?cè)谡麄€(gè)城市的不同街區(qū)發(fā)現(xiàn)了病毒毒株集群,這表明在3月18日之前,未被追蹤的社區(qū)傳播已經(jīng)在進(jìn)行。我們的研究結(jié)果凸顯了在出現(xiàn)這種新型病原體的情況下,采取早期公共衛(wèi)生應(yīng)對(duì)措施的必要性。希望我們所發(fā)現(xiàn)的有關(guān)早期病毒傳播和引入而成為全國(guó)疫情中心的證據(jù),能夠?yàn)榻窈笤谝咔樵缙趹?yīng)對(duì)階段開(kāi)展的公共衛(wèi)生工作提供指導(dǎo)。”