去除核酸提取步驟
我們已經(jīng)知道,大規(guī)模的核酸檢測(cè)和對(duì)受到感染的患者接觸過(guò)的人進(jìn)行追蹤,是控制新冠疫情擴(kuò)展的有效手段之一。目前最常見(jiàn)的檢測(cè)方法是使用鼻咽拭子獲取樣本進(jìn)行基于RT-PCR的核酸檢測(cè)。然而,獲取鼻咽拭子樣本的過(guò)程對(duì)人們來(lái)說(shuō)并不是一個(gè)很舒服的過(guò)程,而且目前的核酸檢測(cè)大多需要經(jīng)過(guò)從樣本中純化提取核酸的步驟。這一步驟不但增加了處理樣本的時(shí)間和成本,也可能因?yàn)楹怂峒兓噭┖械亩倘倍绊懶鹿跈z測(cè)的速度。
耶魯大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院的研究人員力圖開(kāi)發(fā)一種基于唾液樣本的“簡(jiǎn)易版”新冠病毒檢測(cè)。他們首先通過(guò)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在沒(méi)有添加防腐劑的情況下,唾液中的新冠病毒RNA在室溫和30°C情況下保存的穩(wěn)定性與在4°C情況下穩(wěn)定性相當(dāng)。這意味著唾液樣本不需要特制的樣本瓶來(lái)收集,任何無(wú)菌樣本瓶都可以用于收集唾液樣本,為收集唾液樣本提供了便利。
然后,研究人員進(jìn)一步探索簡(jiǎn)化核酸檢測(cè)流程的方法。他們將樣本處理過(guò)程簡(jiǎn)化為將蛋白酶K(在DNA提取過(guò)程中常用的一種蛋白酶)加入樣本中降解蛋白之后,直接將處理過(guò)的樣本用于RT-PCR的檢測(cè)流程,去除了從樣本中純化提取核酸的步驟。
研究人員的實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),基于唾液樣本,去除純化提取核酸步驟的“簡(jiǎn)易版”檢測(cè)流程得出的檢測(cè)結(jié)果,與基于鼻咽拭子,使用純化提取核酸步驟的常規(guī)RT-PCR檢測(cè)相比,結(jié)果相關(guān)性達(dá)到94%。
▲SalivaDirect核酸檢測(cè)流程和測(cè)試表現(xiàn)(圖片來(lái)源:參考資料[3])
擴(kuò)展檢測(cè)適用范圍
為了讓這一檢測(cè)能夠被更多的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室使用,研究人員還使用不同廠家生產(chǎn)的蛋白酶K和RT-PCR試劑盒進(jìn)行了測(cè)試。他們發(fā)現(xiàn)多種常見(jiàn)的蛋白酶K和RT-PCR試劑盒可以用于這一“簡(jiǎn)易版”新冠檢測(cè)流程,檢測(cè)靈敏度達(dá)到6-12個(gè)新冠病毒拷貝/微升。這意味著,很多檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室不需要購(gòu)買特別的試劑,只要遵循耶魯大學(xué)發(fā)布的檢測(cè)流程,利用手邊已有的試劑就可以構(gòu)建這一檢測(cè)。
▲經(jīng)過(guò)驗(yàn)證適用于SalivaDirect流程的試劑和儀器(圖片來(lái)源:參考資料[3])
耶魯大學(xué)的研究人員同時(shí)表示,他們將為所有感興趣的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室提供“開(kāi)源“檢測(cè)流程,幫助它們提高新冠病毒檢測(cè)的效率。同時(shí)他們正在進(jìn)一步驗(yàn)證這一檢測(cè)流程在發(fā)現(xiàn)無(wú)癥狀患者方面的能力。研發(fā)人員表示,針對(duì)新冠病毒的檢測(cè)需要不斷的創(chuàng)新,從而在保持檢測(cè)準(zhǔn)確性的情況下,讓它們更為迅速,便捷,可及性更高,這項(xiàng)研究是向這一方向邁出的重要一步。