關(guān)于這次訴訟，要從PD-1的發(fā)現(xiàn)，本庶佑和小野制藥的關(guān)系，美國生物技術(shù)公司Medarex與百時美施貴寶（BMS）的關(guān)系，以及BMS與默沙東（Merck）的關(guān)于Opdivo與Keytruda的專利之戰(zhàn)說起。
事件發(fā)展時間線
1992年，本庶佑最早在淋巴細胞膜上發(fā)現(xiàn)了一種免疫球蛋白受體，當時認為與細胞程序性死亡有關(guān)，故命名為PD-1，1994年本庶佑找到人類的PD-1基因和蛋白，并在1999年首先提出PD-1是一個免疫系統(tǒng)的負調(diào)控因子，隨后本庶佑陸續(xù)發(fā)表了PD-1的免疫機制轉(zhuǎn)導研究，并發(fā)現(xiàn)程序性死亡 T 細胞所表達的 PD-1 分子可用于癌癥治療。
本庶佑向一名前往京都大學的小野制藥研究員建議，合作開發(fā)抗癌藥物，而小野制藥彼時也正急需突破，因此雙方共同展開了合作。
2001年6月左右，本庶佑與小野制藥一起提交了一項國際專利：substance specific to human PD-1，在這個專利保護下，任何物質(zhì)，只要特異性與人PD-1蛋白結(jié)合，就侵犯了本庶佑和小野制藥的專利。
2003年7月，本庶佑與“小野藥品工業(yè)”按照1比1的分配比例申請了專利。
2005年5月，本庶佑、小野制藥和Medarex宣布達成合作協(xié)議，小野制藥獲得PD-1抗體除北美以外的全球權(quán)益，而Medarex保留PD-1抗體在北美的商業(yè)權(quán)益。
2006年6月，本庶佑、小野制藥和Medarex共同合作開發(fā)抗PD-L1和抗PD-1人用單株抗體中的一種抗PD-1單株抗體——Opdivo，向美國FDA遞交研究性新藥(IND)申請；并于同年開始針對復發(fā)及難治型實體腫瘤患者(非小細胞肺癌、大腸癌、黑色素瘤等)進行臨床試驗。
2006年10月本庶佑與小野制藥簽訂了包含支付專利費的合同，然而支付給本庶佑的專利費卻不足銷售額的1%。
2009年，Medarex被BMS收購，Opdivo的臨床試驗、知識產(chǎn)權(quán)與后續(xù)開發(fā)權(quán)利由BMS所主導。至此，Opdivo的專利權(quán)包括小野制藥和本庶佑，BMS則擁有此專利權(quán)的獨占實施許可。
2014年6月，Opdivo在日本獲得批準用于治療黑色素瘤，成為全球第一個被批準的PD-1，而正受困于專利斷崖及仿制藥競爭小野制藥迅速獲得新的增長，當年春季，小野制藥總市值達到約3萬億日元，在日本藥品制造業(yè)中躍居第二。
2014年9月4日，默沙東PD-1單抗Keytruda獲FDA批準。當夜，BMS向默沙東提起訴訟,稱默沙東的Keytruda侵犯了BMS/小野制藥關(guān)于PD-1抗體用于治療癌癥的系列專利。
隨后，兩家公司就這兩款PD-1藥物的專利權(quán)展開了長時間的拉鋸戰(zhàn)，期間，本庶佑前往美國出庭作證，并為訴訟提供了其他支持。
2017年1月20日，BMS/小野制藥宣布和默沙東就PD-1單抗的專利訴訟簽署了一項和解及全球?qū)＠S可協(xié)議：默沙東要向BMS/小野制藥支付6.25億美元的首付款，以及在2017-2023年間Keytruda銷售額的6.5%，2024-2026年間Keytruda銷售額的2.4%，BMS和小野將按75/25的比例分成。粗略估算默沙東總共將支付超過60億美元（合6420億日元）。
2019年4月，本庶佑在新聞發(fā)布會上表示要求與小野制藥重新開展合同談判。本庶佑及其律師稱，拒絕接受小野制藥約26億日元的報價，2006年簽署協(xié)議時，小野制藥對本庶佑的報酬沒有給予充分的解釋，本庶佑僅能從該藥的銷售和許可收入中獲得不到1%的份額，這不能反映出其所做的貢獻。律師表示合理的水平是5%到10%。同時，本庶佑表示希望與小野制藥公司直接談判，避免訴訟程序。
3年無果的談判之后——訴訟
2020年6月，本庶佑宣布，將對小野制藥公司提起訴訟。
本庶佑表示，當年小野制藥在與他簽訂賠償協(xié)議時，因為沒有預料到本庶佑在專利案中的作用，所以小野制藥承諾會向他支付默沙東提供和解金的40%，且無論和解金最終是多少，但之后，小野制藥又表示，只會向他支付1%的報酬；而持續(xù)到目前，小野制藥還未向他支付任何款項。
在與小野制藥進行了3年無果的談判之后，他決定將此事提交法庭。該訴訟將于6月中旬在大阪地方法院提起。
當年本庶佑想為其PD-1研究成果申請專利，但包括京都大學在內(nèi)的日本高校“沒有任何管理或申請專利的能力，甚至無法支付專利申請的費用”，于是本庶佑轉(zhuǎn)向了小野制藥，“我和小野制藥沒有在科學研究方面有過任何的合作，但是他們幫我申請到了專利”，本庶佑表示，日本企業(yè)仍在從科學家的研究成果中獲益，“我們認為這一訴訟不僅針對我自己的情況，而且還支持學術(shù)界的許多其他科學家。”
此前，本庶佑已承諾將他在和解中得到的一部分賠償金捐贈給京都大學，以建立一擁有1000億日元資金的基金會，支持年輕的研究人員。
